Aquamark 3 est un benchmark ayant pour but principal de tester les Pixel et les Vertex Shaders dans leur intégralité. Cela signifie que les effets produits par ce logiciel au cours du test sont réalisés par des Vertex Shaders dans leur version 1.1 (DX8) et 2.0 (DX9) et par des Pixel Shaders 1.1, 1.4 (DX8) et 2.0 (DX9). Le benchmark se décompose en 9 tests successifs utilisant différentes fonctionnalités hardware de la carte afin de la juger dans son ensemble.

Sans options telles que l'antialiasing ou le filtrage anisotrope activées, on constate que c'est la Geforce FX 5950 Ultra qui s'en sort le mieux dans ce test, à 500/500 MHz comme à 475/475 MHz. On notera justement que l'écart entre les deux fréquences n'est pas très élevé. La Radeon 9800 XT se trouve peu après, la 9700 Pro fermant la marche. En revanche, lorsqu'on se place en AA 4x et Aniso 8x c'est la 9800 XT qui repasse d'une courte tête devant par rapport à la Sparkle à 500/500 MHz, la 9700 Pro étant du même niveau que cette dernière à 475/475 MHz. L'écart entre les deux fréquences pour la Sparkle se montre ici plus élevé que sans AA ou filtrage anisotrope.